MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 chromosome

Total Repeats: 65884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009328	CGAA	2	8	253	260	50 %	0 %	25 %	25 %	138893680
2	NC_009328	CGA	2	6	297	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
3	NC_009328	TGA	2	6	463	468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893680
4	NC_009328	CGT	2	6	483	488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893680
5	NC_009328	A	6	6	494	499	100 %	0 %	0 %	0 %	138893680
6	NC_009328	CGTT	2	8	570	577	0 %	50 %	25 %	25 %	138893680
7	NC_009328	GCC	2	6	605	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893680
8	NC_009328	CGG	2	6	664	669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893680
9	NC_009328	AC	3	6	686	691	50 %	0 %	0 %	50 %	138893680
10	NC_009328	GTC	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893680
11	NC_009328	TTA	2	6	780	785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	138893680
12	NC_009328	GAC	2	6	809	814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
13	NC_009328	TGA	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893680
14	NC_009328	AC	3	6	915	920	50 %	0 %	0 %	50 %	138893680
15	NC_009328	GAA	2	6	926	931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893680
16	NC_009328	AGCA	2	8	932	939	50 %	0 %	25 %	25 %	138893680
17	NC_009328	CCA	2	6	962	967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	138893680
18	NC_009328	CGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893680
19	NC_009328	A	6	6	1073	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	138893680
20	NC_009328	CGAA	2	8	1104	1111	50 %	0 %	25 %	25 %	138893680
21	NC_009328	CCAA	2	8	1128	1135	50 %	0 %	0 %	50 %	138893680
22	NC_009328	CGT	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893680
23	NC_009328	TCA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893680
24	NC_009328	GTT	2	6	1298	1303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893680
25	NC_009328	GCA	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
26	NC_009328	A	7	7	1342	1348	100 %	0 %	0 %	0 %	138893680
27	NC_009328	TC	3	6	1390	1395	0 %	50 %	0 %	50 %	138893680
28	NC_009328	CTGA	2	8	1403	1410	25 %	25 %	25 %	25 %	138893680
29	NC_009328	CGA	2	6	1432	1437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
30	NC_009328	GGC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893680
31	NC_009328	ACG	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893680
32	NC_009328	A	6	6	1479	1484	100 %	0 %	0 %	0 %	138893680
33	NC_009328	AAC	2	6	1804	1809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893681
34	NC_009328	GCTT	2	8	1923	1930	0 %	50 %	25 %	25 %	138893681
35	NC_009328	TGC	2	6	1959	1964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893681
36	NC_009328	GC	3	6	1967	1972	0 %	0 %	50 %	50 %	138893681
37	NC_009328	T	6	6	1973	1978	0 %	100 %	0 %	0 %	138893681
38	NC_009328	CAA	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893681
39	NC_009328	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893681
40	NC_009328	TTA	2	6	2153	2158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	138893681
41	NC_009328	CGT	2	6	2332	2337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893681
42	NC_009328	CAGT	2	8	2394	2401	25 %	25 %	25 %	25 %	138893681
43	NC_009328	CCAA	2	8	2415	2422	50 %	0 %	0 %	50 %	138893681
44	NC_009328	GTT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893681
45	NC_009328	TCT	2	6	2443	2448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893681
46	NC_009328	GTC	2	6	2525	2530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893681
47	NC_009328	CGAT	2	8	2553	2560	25 %	25 %	25 %	25 %	138893681
48	NC_009328	CTTG	2	8	2569	2576	0 %	50 %	25 %	25 %	138893681
49	NC_009328	GAAG	2	8	2582	2589	50 %	0 %	50 %	0 %	138893681
50	NC_009328	GAC	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893681
51	NC_009328	GGA	2	6	2621	2626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	138893681
52	NC_009328	TTC	2	6	2638	2643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893681
53	NC_009328	GAA	2	6	2702	2707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893681
54	NC_009328	ATG	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893681
55	NC_009328	TTG	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	138893681
56	NC_009328	TAC	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893682
57	NC_009328	GCT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893682
58	NC_009328	TTGA	2	8	3125	3132	25 %	50 %	25 %	0 %	138893682
59	NC_009328	GGC	2	6	3137	3142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893682
60	NC_009328	CAT	2	6	3369	3374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893683
61	NC_009328	ATG	2	6	3406	3411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
62	NC_009328	CGCAC	2	10	3443	3452	20 %	0 %	20 %	60 %	138893683
63	NC_009328	ACGA	2	8	3454	3461	50 %	0 %	25 %	25 %	138893683
64	NC_009328	GAAG	2	8	3502	3509	50 %	0 %	50 %	0 %	138893683
65	NC_009328	AAGCG	2	10	3517	3526	40 %	0 %	40 %	20 %	138893683
66	NC_009328	A	6	6	3555	3560	100 %	0 %	0 %	0 %	138893683
67	NC_009328	A	6	6	3564	3569	100 %	0 %	0 %	0 %	138893683
68	NC_009328	CAG	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
69	NC_009328	TA	3	6	3727	3732	50 %	50 %	0 %	0 %	138893683
70	NC_009328	GCA	2	6	3762	3767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
71	NC_009328	ATG	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
72	NC_009328	AGC	2	6	3839	3844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
73	NC_009328	GGC	2	6	3855	3860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893683
74	NC_009328	GCG	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893683
75	NC_009328	CCA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	138893683
76	NC_009328	TAG	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
77	NC_009328	GCC	2	6	4036	4041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893683
78	NC_009328	GA	3	6	4044	4049	50 %	0 %	50 %	0 %	138893683
79	NC_009328	ACG	2	6	4069	4074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
80	NC_009328	TGA	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
81	NC_009328	A	6	6	4119	4124	100 %	0 %	0 %	0 %	138893683
82	NC_009328	GCA	2	6	4149	4154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893683
83	NC_009328	ACA	2	6	4159	4164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893683
84	NC_009328	GAT	2	6	4237	4242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893683
85	NC_009328	CCT	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	138893683
86	NC_009328	A	6	6	4297	4302	100 %	0 %	0 %	0 %	138893683
87	NC_009328	ACA	2	6	4321	4326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893683
88	NC_009328	AAG	2	6	4358	4363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893683
89	NC_009328	GCC	2	6	4396	4401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893683
90	NC_009328	CTT	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	138893683
91	NC_009328	AAC	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893684
92	NC_009328	TCG	2	6	4598	4603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
93	NC_009328	ACA	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893684
94	NC_009328	CGG	2	6	4770	4775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893684
95	NC_009328	TGG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	138893684
96	NC_009328	GGC	2	6	4807	4812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893684
97	NC_009328	ACGA	2	8	4904	4911	50 %	0 %	25 %	25 %	138893684
98	NC_009328	CGA	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893684
99	NC_009328	GAC	3	9	4962	4970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893684
100	NC_009328	AAC	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893684
101	NC_009328	T	6	6	5055	5060	0 %	100 %	0 %	0 %	138893684
102	NC_009328	GGT	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	138893684
103	NC_009328	TGC	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
104	NC_009328	ACG	2	6	5249	5254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893684
105	NC_009328	AAC	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893684
106	NC_009328	AAAAC	2	10	5482	5491	80 %	0 %	0 %	20 %	138893684
107	NC_009328	GC	3	6	5506	5511	0 %	0 %	50 %	50 %	138893684
108	NC_009328	ATG	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893684
109	NC_009328	GC	4	8	5608	5615	0 %	0 %	50 %	50 %	138893684
110	NC_009328	A	6	6	5629	5634	100 %	0 %	0 %	0 %	138893684
111	NC_009328	GC	3	6	5635	5640	0 %	0 %	50 %	50 %	138893684
112	NC_009328	GC	3	6	5660	5665	0 %	0 %	50 %	50 %	138893684
113	NC_009328	GCTG	2	8	5691	5698	0 %	25 %	50 %	25 %	138893684
114	NC_009328	GA	3	6	5709	5714	50 %	0 %	50 %	0 %	138893684
115	NC_009328	ATCA	2	8	5718	5725	50 %	25 %	0 %	25 %	138893684
116	NC_009328	CGT	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
117	NC_009328	CGG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	138893684
118	NC_009328	CGAC	2	8	5781	5788	25 %	0 %	25 %	50 %	138893684
119	NC_009328	AAT	2	6	5863	5868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	138893684
120	NC_009328	ATC	2	6	5881	5886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893684
121	NC_009328	GCC	2	6	6063	6068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893684
122	NC_009328	TA	3	6	6071	6076	50 %	50 %	0 %	0 %	138893684
123	NC_009328	A	6	6	6128	6133	100 %	0 %	0 %	0 %	138893684
124	NC_009328	GAT	2	6	6165	6170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	138893684
125	NC_009328	ACG	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	138893684
126	NC_009328	TGC	2	6	6248	6253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
127	NC_009328	CGT	2	6	6325	6330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893684
128	NC_009328	GAA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893684
129	NC_009328	AAC	2	6	6544	6549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	138893685
130	NC_009328	CG	3	6	6625	6630	0 %	0 %	50 %	50 %	138893685
131	NC_009328	CCG	2	6	6668	6673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893685
132	NC_009328	CCG	2	6	6706	6711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	138893685
133	NC_009328	A	6	6	6723	6728	100 %	0 %	0 %	0 %	138893685
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135	NC_009328	AT	3	6	6830	6835	50 %	50 %	0 %	0 %	138893685
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267	NC_009328	CGCT	2	8	18316	18323	0 %	25 %	25 %	50 %	138893688
268	NC_009328	TCG	2	6	18340	18345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	138893688
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271	NC_009328	GTTT	2	8	18630	18637	0 %	75 %	25 %	0 %	138893689
272	NC_009328	CTA	2	6	18640	18645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	138893689
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274	NC_009328	GC	3	6	18701	18706	0 %	0 %	50 %	50 %	138893689
275	NC_009328	GAA	2	6	18755	18760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	138893689
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292	NC_009328	A	7	7	19708	19714	100 %	0 %	0 %	0 %	138893689
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392	NC_009328	GT	3	6	25165	25170	0 %	50 %	50 %	0 %	138893694
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